Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP36Q9P275 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms