Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CALCOCO1Q9P1Z2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALCOCO1Q9P1Z2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms