Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRHL1Q9NZI5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRHL1Q9NZI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms