Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKIRAS1Q9NYS0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms