Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 219.52■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 516.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 511.12□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-9■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-9■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-9■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-9■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-9■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.198e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 FLVCR1-202ENST00000419102 1108 ntTSL 517.08■□□□□ 0.328e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 APC-206ENST00000507379 3602 ntTSL 215.64■□□□□ 0.18e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 APC-208ENST00000508624 7406 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.488e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.648e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 APC-210ENST00000512211 4061 ntTSL 24.77□□□□□ -1.658e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.918e-8■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.713e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.493e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 329.05■■■□□ 2.243e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.133e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 23e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.823e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.433e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 524.37■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 224.32■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 20.9
AATFQ9NY61 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 517.25■□□□□ 0.357e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 314.71□□□□□ -0.057e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 514.71□□□□□ -0.057e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 514.52□□□□□ -0.097e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.247e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 212.8□□□□□ -0.367e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 212.68□□□□□ -0.387e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.417e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.527e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 211□□□□□ -0.657e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 58.15□□□□□ -1.17e-11■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.464e-6■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 20.8
AATFQ9NY61 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.077e-8■■■■□ 20.7
AATFQ9NY61 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 214.46□□□□□ -0.097e-8■■■■□ 20.7
AATFQ9NY61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 525.7■■□□□ 1.71e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 222.76■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 421.94■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 521.02■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.9■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 20.6
AATFQ9NY61 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 417.39■□□□□ 0.379e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-217ENST00000582613 617 ntTSL 231.54■■■□□ 2.644e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)31.34■■■□□ 2.612e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-206ENST00000534219 546 ntTSL 330.52■■■□□ 2.484e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-205ENST00000527952 626 ntTSL 529.54■■■□□ 2.324e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-220ENST00000585085 927 ntTSL 529.16■■■□□ 2.264e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 229.13■■■□□ 2.254e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 228.84■■■□□ 2.214e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)27.67■■■□□ 2.022e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 226.5■■□□□ 1.834e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 526.35■■□□□ 1.814e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 526.25■■□□□ 1.794e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.742e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 525.88■■□□□ 1.734e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 525.75■■□□□ 1.714e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.694e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.682e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)25.54■■□□□ 1.682e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 525.4■■□□□ 1.664e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 324.7■■□□□ 1.544e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.464e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 323.96■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.372e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.364e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 523.28■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.312e-56■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 422.87■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.24e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 DCXR-209ENST00000579155 430 ntTSL 522.25■■□□□ 1.154e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 521.52■■□□□ 1.044e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 221.5■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 521.15■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 521.02■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.944e-7■■■■□ 20.5
AATFQ9NY61 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 20.5
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