Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX43Q9NXZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms