Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK1Q9NWW6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK1Q9NWW6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms