Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMSN1Q9NSI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms