Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC6A13Q9NSD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A13Q9NSD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms