Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A11Q9NSA0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A11Q9NSA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms