Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST12Q9NRB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST12Q9NRB3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms