Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-206ENST00000467278 2725 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 355.1
UTP3Q9NQZ2 GNL3L-201ENST00000336470 2357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 354.9
UTP3Q9NQZ2 GNL3L-202ENST00000360845 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 354.9
UTP3Q9NQZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.786e-7■■■■■ 354.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC137-206ENST00000575223 1888 ntTSL 523.37■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 354.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.35■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 354.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 354.6
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 354.6
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 354.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-208ENST00000538662 1186 ntTSL 216.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 354.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-204ENST00000436115 2879 ntTSL 516.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 354.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-209ENST00000538929 630 ntTSL 415.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 354.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 354.5
UTP3Q9NQZ2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L3-210ENST00000591295 3017 ntTSL 514.16□□□□□ -0.142e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 GUCY1B2-206ENST00000533288 376 ntTSL 313.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 PDE6C-201ENST00000371447 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.463e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 MARF1-214ENST00000552553 5053 ntTSL 511.55□□□□□ -0.563e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-206ENST00000461312 670 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-207ENST00000521950 1177 ntTSL 1 (best)8.92□□□□□ -0.982e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.023e-14■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.062e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-203ENST00000518386 813 ntTSL 37.43□□□□□ -1.222e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 FMNL3-204ENST00000550424 547 ntTSL 47.21□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-201ENST00000297450 4353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.632e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ANGPT1-202ENST00000517746 4322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.82e-28■■■■■ 354
UTP3Q9NQZ2 ZNF217-203ENST00000431687 779 ntTSL 59.39□□□□□ -0.918e-9■■■■■ 353.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF217-205ENST00000540425 568 ntTSL 37.36□□□□□ -1.238e-9■■■■■ 353.7
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-212ENST00000590096 1282 ntTSL 522.81■■□□□ 1.242e-45■■■■■ 353
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-203ENST00000585752 729 ntTSL 519.81■□□□□ 0.762e-45■■■■■ 353
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-205ENST00000586477 628 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-45■■■■■ 353
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-207ENST00000587256 607 ntTSL 515.83■□□□□ 0.122e-45■■■■■ 353
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-206ENST00000586863 529 ntTSL 414.83□□□□□ -0.042e-45■■■■■ 353
UTP3Q9NQZ2 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 224.41■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 352.1
UTP3Q9NQZ2 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 324.18■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 352.1
UTP3Q9NQZ2 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 322.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 352.1
UTP3Q9NQZ2 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 418.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 352.1
UTP3Q9NQZ2 PDS5A-205ENST00000506262 559 ntTSL 314.43□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 351.7
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 350.9
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 213.43□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 350.9
UTP3Q9NQZ2 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 350.9
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 312.15□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 350
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 57.8□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 350
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.383e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.763e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 MED12-206ENST00000460771 330 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.873e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-207ENST00000489407 373 ntTSL 28.74□□□□□ -1.013e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-201ENST00000372849 433 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.253e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.373e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.373e-36■■■■■ 349.4
UTP3Q9NQZ2 CTIF-205ENST00000587860 2940 ntTSL 216.61■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 349.1
UTP3Q9NQZ2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 349
UTP3Q9NQZ2 RABEP1-207ENST00000575991 551 ntTSL 419.73■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 349
UTP3Q9NQZ2 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 349
UTP3Q9NQZ2 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 349
UTP3Q9NQZ2 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 348.8
UTP3Q9NQZ2 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 348.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM106B-205ENST00000444443 584 ntTSL 421.5■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 347.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM106B-203ENST00000420833 1492 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 347.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 347.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 347.9
UTP3Q9NQZ2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-210ENST00000534080 1379 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-234ENST00000642041 943 nt18.09■□□□□ 0.492e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-208ENST00000477564 2096 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-205ENST00000416156 1669 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 ADCK1-206ENST00000556048 765 ntTSL 316.69■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PGAM1-203ENST00000473929 497 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-209ENST00000527167 1712 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-207ENST00000496756 508 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-224ENST00000641711 712 nt10.84□□□□□ -0.672e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-219ENST00000641513 735 nt9.59□□□□□ -0.872e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-16■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.071e-16■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-225ENST00000641720 548 nt7.89□□□□□ -1.152e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-20■■■■■ 347.8
UTP3Q9NQZ2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 347.6
UTP3Q9NQZ2 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 347.6
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.13e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-207ENST00000539436 1726 ntTSL 220.74■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 346.8
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-214ENST00000545812 681 ntTSL 320.5■□□□□ 0.873e-9■■■■■ 346.8
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