Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPHNQ9NQX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPHNQ9NQX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPHNQ9NQX3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms