Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM8Q9NQV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms