Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPNPEP3Q9NQH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPNPEP3Q9NQH7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms