Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH12Q9NPG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH12Q9NPG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH12Q9NPG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms