Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms