Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPHS2Q9NP85 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms