Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPB41L4AQ9HCS5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L4AQ9HCS5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms