Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7BQ9H9Q2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7BQ9H9Q2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms