Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf88Q9H8K7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf88Q9H8K7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms