Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF1Q9H7N4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF1Q9H7N4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms