Protein–RNA interactions for Protein: Q9H078

CLPB, Caseinolytic peptidase B protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPBQ9H078 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPBQ9H078 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPBQ9H078 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms