Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAIP1Q9H074 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAIP1Q9H074 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms