Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGIF2Q9GZN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms