Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRY4Q9C004 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRY4Q9C004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY4Q9C004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms