Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM31Q9BZY9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM31Q9BZY9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM31Q9BZY9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms