Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP8Q9BV40 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms