Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFJQ9BTM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms