Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms