Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM79Q9BSE2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM79Q9BSE2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms