Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms