Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA1CQ9BQE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms