Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUSP9Q99956 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP9Q99956 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP9Q99956 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms