Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGRRF1Q99675 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGRRF1Q99675 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGRRF1Q99675 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms