Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORT1Q99523 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORT1Q99523 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORT1Q99523 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms