Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN2Q99439 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN2Q99439 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNN2Q99439 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNN2Q99439 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN2Q99439 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms