Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF12Q99081 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF12Q99081 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms