Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UHRF1Q96T88 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UHRF1Q96T88 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms