Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIN3AQ96ST3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SIN3AQ96ST3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SIN3AQ96ST3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms