Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPXM1Q96SM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPXM1Q96SM3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPXM1Q96SM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms