Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIGSQ96S52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIGSQ96S52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIGSQ96S52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms