Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP5Q96RT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP5Q96RT8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP5Q96RT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms