Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IPQ96QF0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IPQ96QF0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms