Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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