Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC3BQ96NL0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms