Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF558Q96NG5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF558Q96NG5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF558Q96NG5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms