Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf49Q96NF6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms