Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NSMCE3Q96MG7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms