Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC114Q96M63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC114Q96M63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms